1- يقوم القسم بإعداد الأبحاث العلمية التي تنشر في أكبر المجلات العلمية العالمية وذلك في كل من المجالات الآتية:
- الفيروسات الكبدية: تشخيصها وعلاجها
- أمراض الكبد الدهنية ومضاعفاتها
- تليف الكبد: أسبابه وتشخيصه ومضاعفاته وعلاجه
- زراعة الكبد
- أورام الكبد
- التداخل الكبدي
- الأمراض المعدية والمتوطنة وأمراض المناطق الحارة
- مناظير الجهاز الهضمي: العلوية ومناظير القولون والقنوات المرارية ومناظير السونار
- أمراض وأورام والجهاز الهضمي: الأسباب والمضاعفات والتشخيص والعلاج
- تقنيات النانو في أمراض الكبد والجهاز الهضمي
- الخلايا الجذعية في مجال الكبد والجهاز الهضمي
2- يشارك القسم في العديد من المشاريع البحثية التي تخدم مرضى الكبد والجهاز الهضمي والحميات والأمراض المعدية على سبيل المثال: -
- المشروع البحثي الممول من صندوق التنمية والعلوم التكنولوجية لفحص الطبي المبكر للتليف الكبدي
- المشروع البحثي الممول من صندوق التنمية والعلوم التكنولوجية للفحص الطبي واكتشاف الإصابة بفيروس (سي) داخل العائلات المصرية
- بروتوكول التعاون بين قسم الامراض المتوطنة ومركز علاج الاورام للمسح الطبي لأمراض القولون وتشخيص اورام القولون
- المشروع الممول من جامعة المنصورة للاكتشاف المبكر لأورام الكبد.
- المشروع البحثي الممول من جامعة المنصورة لعلاج كوفيد 19.