يشمل عدد 5 معامل كالتالى :

• ثلاثة معامل لطلبة البكالوريوس مزودة بميكروسكوبات كهربائية و أجهزة كمبيوتر و أجهزة عرض
• معملين لطلبة الدراسات العليا والأبحاث يحتويان على العديد من الأجهزة والمعدات اللازمة لإجراء أنواع مختلفة من الفحوصات المعملية الطفيلية .

    * يتم التدريس به: علم الطفيليات الطبية الطفيليات التي تصيب البشر ) الديدان و الأوليات و المفصلي (و التفاعلات بين الطفيل و العائل و الأمراض الناتجة و أعراضها الإكلينيكية و الطرق المختلفة المستخدمة في تشخيصها بالإضافة إلى إجراءات العلاج و الوقاية و السيطرة عليها.

  * تقوم  معامل القسم بإجراء الفحوصات المعملية التالية :

     -  فحص البراز

- استخدام تقنيات تركيز مختلفة (الترسيب و الطفو)

- المسحات المصبوغة بأنواع مختلفة من الصبغات

- الكشف الكمي عن العدوى الطفيلية

      - فحص الشرائح المصبوغة لعينات الدم باستخدام الميكروسكوب للحالات المحولة من قسم طب المناطق الحارة و المشتبه بإصابتها بالملاريا أو داء الليشمانيات أو داء الفيل

- فحص عينات مختلفة من البالغين و الأطفال الذين يعانون من نقص المناعة (مثل متلقي زراعة نخاع العظام و مرضى السرطان) للكشف عن العدوى بالطفيليات الانتهازية إجراء الاختبارات المناعية مثل الاليزا