تأسس قسم الميكروبيولوجيا والمناعة الطبية عام 1965 على يد الأستاذ الدكتور يحيى شاهين.

منذ عام 1965 وحتى الآن، تم انتخاب 13 رئيسًا على النحو التالي:
1. أ.د. يحيى شاهين (1965-1971).
2. أ.د عبد الرحمن شقير (1971-1975).
3. أ.د رمضان محفوظ (1975-1984) و(1990-1993).
4. أ.د سمير خير الله (1984-1990).
5. أ.د مدحت محمد علي (1993-1999).
6. أ.د محمد صبري رزق (1999-2005).
7. أ.د محمد فتح الله بدر (2005-2006).
8. أ.د سامية حواس (يوليو-أكتوبر 2006).
9. أ.د محمد فؤاد القناوي (2006-2009).
10. أ.د ناريمان النشار (2009-2010).
11. أ.د فكري المرسي ​​(2010-2012).
12. أ.د. محمد أبو العلا (2012-2018).
13. أ.د سحر طاهر محمد (2018-2021).
14. أ.د مدحت الدكر (2021-حتى الآن)

أعضاء هيئة التدريس الذين سيبقون في قلوبنا (رحمهم الله):

 أ.د يحيى شاهين.
 أ.د عبد الرحمن شقير.
 أ.د رمضان محفوظ.
 أ.د سمير خير الله.
 أ.د محمد صبري رزق.
 أ.د سامية حواس.
 د. أميمة علي السيد.
 د. إيمان محمود عبد النبي.
 أ.د محمد فؤاد القناوي.