تأسس قسم جراحة المخ والأعصاب بكلية الطب بالمنصورة والمستشفى الجامعي الرئيسي في عام 1992 كوحدة لقسم الجراحة العامة وتم فصله كقسم مستقل اعتبارًا من عام 2004.

يخدم القسم ممثلاً عن مرضى مستشفى جامعة المنصورة بمحافظة الدقهلية (أكثر من 6 ملايين نسمة) بالإضافة إلى أعداد كبيرة من المرضى في المحافظات المجاورة (المحافظات الشرقية والغربية، كفر الشيخ، دمياط، بورسعيد).

يضم قسم جراحة المخ والأعصاب حاليًا عدد (50 سريرًا) داخل المستشفى الرئيسي بالإضافة إلى عدد (6 أسرة) في العناية المركزة وكذلك عدد (20 سريرًا) في القسم الداخلي بمستشفى الطوارئ في اضافة الى عدد (9 اسرة) للعناية المركزة الى اجمالي اسرة القسم (85 سريرا)

تم إنشاء مجموعات عمل متخصصة بالقسم اعتبارًا من يناير 2014 تعمل في مختلف التخصصات الفرعية لجراحة المخ والأعصاب (بالإضافة إلى التخصص العام في القسم) وتضم كلاً من الأساتذة والأساتذة المساعدين والمدرسين تمهيدًا لإنشاء وحدات متخصصة في المستقبل تتماشى مع الاتجاه العام لتشجيع التخصصات الدقيقة وتقديم خدمة أفضل للمرضى والبحث العلمي.

تشمل التخصصات الدقيقة حاليًا ما يلي:

1- جراحة العمود الفقري والنخاع الشوكي والأعصاب الطرفية.

2- جراحة أعصاب الأطفال.

3- جراحة المخ والأعصاب الوعائية وجراحة المخ والأعصاب بالأشعة التداخلية (قسطرة الأوعية الدموية للجهاز العصبي).

4- جراحة قاعدة الجمجمة.

5- جراحة أورام المخ.

يوجد حاليًا اتجاه في القسم لتشكيل تخصصات فرعية مستقبلية لتشمل التخصصات الفرعية التالية:

1- إصابات الجهاز العصبي.

2- جراحة المخ والأعصاب وجراحة النخاع الشوكي.

3- جراحة المخ والأعصاب الوظيفية والثلاثي الأبعاد.